Como todo buen FPS en una consola, el Area 51 tiene el handicap de tener un control más impreciso y frágil de lo que sería jugarlo en un PC con el ratón y el teclado. No obstante, mucho han cambiado las cosas desde que los primeros shooters hiciesen aparición en el mundo de las consolas de sobremesa, siendo ahora los juegos mucho más dóciles a la hora de mover al personaje.
El control de Ethan es bastante bueno y responde perfectamente a lo que se espera de él; como es habitual tendremos que usar los dos sticks analógicos para los movimientos clásicos de avanzar y apuntar, el gatillo derecho para disparar y el izquierdo para hacer un pequeño zoom en la mira, quedando el botón A para el salto, el B para lanzar granadas y el X para la recarga del arma e interactuar con botones, mandos o paneles en el juego. El problema, sin embargo, viene a la hora del resto de asignación de botones que es algo equivocada; para empezar el botón Y es usado para pasar a la siguiente arma coincidiendo en esas funciones con los botones blanco y negro mientras que pulsando el stick izquierdo hacia abajo, se conseguirá que Ethan se agache. Esto que en principio puede pasarse por alto resulta de lo más molesto ya que se ha de avanzar mientras se mantiene agachado utilizando el mismo stick, cuando quizás hubiese sido más fácil dejar esta función en el botón Y evitando así la redundancia de los botones; al menos las ocasiones en las que se requiere, obligatoriamente, agacharse son bastante escasas a lo largo del juego, y, salvo que que se quiera utilizar como método de resguardarse de los ataques enemigos, no da demasiados problemas.
Todo esto hubiera podido resolverse permitiendo al usuario definir los controles a su elección directamente en el perfil del jugador, pero por lo que quiera que sea no ha sido así, ni siquiera en las opciones generales de juego.
Y lo peor es que ésta no es la única carencia de los menús de opciones ya que tal y como se ha comentado en lo que al apartado sonoro se refiere, el juego no permite seleccionar manualmente el idioma del juego quedando a expensas de la modificación de los parámetros generales a la que se hacía referencia.
Al menos el juego no es parco en modos de juego ya que incluye tres bien diferenciados que darán muchas horas de diversión al usuario. Para empezar está el tradicional modo Campaña en el que se asumirá el jugador se sumergirá en una profunda historia de conspiraciones, secretos no revelados, enigmáticos personajes y todo bajo el trasfondo de la amenaza biológica y el manido tema de la existencia de vida extraterrestre. En efecto, a lo largo de dieciocho intensos niveles Ethan irá desgranando la historia que se oculta en el Area 51 mientras ve como pierde a varios de sus compañeros, sufre la mutación del virus y es perseguido no sólo por las diferentes criaturas en su correspondientes niveles de mutación sino también por tropas humanas que intentan acabar con su vida en el momento de su contagio. La duración media de los niveles ronda los cuarenta minutos por lo que la vida media de este modo alcanzará sin problemas las doce o trece horas de juego.
El segundo de los modos de juego permitirá partidas multijugador de hasta cuatro jugadores en la misma consola, utilizando las tradicionales pantallas divididas. Por último se incluye un completo modo multijugador a través del servicio Xbox Live de Microsoft que hará las delicias de los amantes del juego online por su posibilidad de partidas de hasta dieciséis jugadores. El multijugador por Xbox Live, que incluye los tradicionales modos Deathmatch individual o por equipos y captura de la bandera, destaca, especialmente por un novedoso modo denominado infección en el que los jugadores han de dividirse en humanos y alienígenas con el único objetivo de sobrevivir.
