Como comentábamos al introducir el análisis del presente título, Guilty Gear Isuka es un título bastante peculiar. La estructuración del modo principal: Arcade, que permite el juego a cuatro personajes a la vez en pantalla, sin duda inspirado en el Dramatic Battle de Street Fighter Alpha y Street Fighter Alpha 3, o Super Smash Bros. Melee, aunque con varios planos de lucha, y sin las distintas alturas del clásico de Nintendo 64 y GameCube. Además, en vez de tratarse de la sucesión de combates antes de llegar hasta el jefe final, el arcade se convertirá en un Survival donde deberemos ir acabando con la vida de los rivales, representado por un número de barras de vida y las almas almacenadas, que nos otorgarán una barra adicional por cada alma. Los combates podrán ser uno contra uno, o podremos enfrentarnos a situaciones de clara desventaja, luchando contra varios personajes controlados por la CPU.
Cada vez que derrotemos a un personaje CPU le robaremos su categoría (Class), con lo que obtendremos unos puntos, si conseguimos acumular cierto número de puntos, aparecerá un personaje EX contra el que deberemos pelear, si le vencemos nos haremos con su control. Al seleccionar un personaje, si pulsamos Start para que aparezca la medalla encima del personaje del que hayamos desbloqueado la versión EXtra, para seleccionarlo
La introducción de la lucha contra varios enemigos y la inclusión de un segundo plano de lucha modifica el sistema de control básico de Guilty Gear, ya que dispondremos de un botón para cambiar la dirección hacia la que miramos, a diferencia de cualquier otro juego de lucha clásico donde este cambio de dirección es automático, y justificado por el hecho de apuntar hacia el rival deseado. Este botón resta algo de fluidez al desarrollo de los combates, ya que será algo tedioso tener que dar un toque al botón cada vez que queramos mirar al otro lado, aunque al menos responde bastante bien.
El otro cambio fundamental incluido es el juego con los distintos planos de lucha, pudiendo escapar hacia el otro plano, con el botón de darse la vuelta más el de cuchillada fuerte, cambiar de plano mientras estamos protegiéndonos, lanzar al rival de un golpe al otro plano, atacar mientras se cambia de plano, o golpear a un rival que se encuentra detrás nuestro. Este juego de planos no es algo totalmente novedoso, ya que los Fatal Fury originales ya disponían de hasta tres planos de lucha, algo que finalmente fue desechado en la entrega mejor valorada: Fatal Fury: Mark of the Wolves, que aparecerá este verano en Japón para PlayStation 2, así como en la conversión a PlayStation de Real Bout Special: Dominated Mind, aunque en este caso obedeció más a un ahorro de cuadros de animación.
Tanto en este modo de juego, como en el modo versus, se formarán equipos de varios integrantes, localizables por el color de cada uno, con lo que podremos jugar hasta cuatro humanos, 3 vs 1, exclusivo del versus, dos contra dos, o cualquier otra combinación excepto claro está, el pertenecer todos al mismo equipo.
Como hemos comentado, además de la barra de vida, el indicador de nivel de guardia, que aumenta cuando nos ponemos en guardia y disminuye cuando no utilizamos la protección, y que además al llegar hasta cierto nivel comenzará a parpadear para mostrarnos que todos los ataques que recibamos tendrán los efectos de contraataque, tendremos la barra de ira, que una vez llena nos permitirá ser invencibles temporalmente, la barra de tensión que nos permitirá realizar los ataque Overdrive y Roman Cancel, así como el indicador de almas, que en el caso de equipos, serán compartidos por los miembros de dicha formación y mostrarán las veces que pueden resucitar antes de morir.
Seguimos teniendo las técnicas habituales de la franquicia, que otorgan a la serie de una personalidad propia bastante diferenciada del resto de sagas clásicas de lucha 2D, algo a lo que contribuye también la peculiar estética de escenarios, personajes, y el dibujo de los luchadores. El sistema jugable de GG Isuka, pese a la concepción de combates múltiples, sigue siendo completísima, prácticamente sin parangón en la lucha 2D, por la cantidad de movimientos y técnicas disponible, lo que lo diferencia de Super Smash Bros., que era bastante más simple en este aspecto.