Además de los mencionados modos duelo y Arcade, el juego incorpora un completo entrenamiento donde podremos practicar la pléyade de técnicas del juego, los listados de movimientos, y que además nos dará la opción de grabar los ataques para que luego los realice nuestro rival.
Dentro de las modalidades más originales de Guilty Gear Isuka, se encuentra el Guilty Gear Boost, un beat'em up de scroll lateral estructurado en misiones, que permitirá el juego cooperativo a dos jugadores, y que nos enfrenta a unas hordas de enemigos a los que deberemos vencer. El movimiento en este modo es más libre, ya que las direcciones que impliquen pulsar arriba y abajo nos moverán tridimensionalmente por los escenarios, como en cualquier Final Fight. Saltaremos con L1, y realizaremos la carrera rápida (Boost Dash) con R1.
Deberemos ir acabando con todos los enemigos para ir pasando de misión antes de llegar al jefe de cada área, que nos granjeará tras vencerlo el acceso a la siguiente sección. Al destruir ciertos barriles encontraremos objetos que recuperarán algo de nuestra vida, como carne, bocadillos, filetes, objetos que aumentarán nuestra velocidad: poción azul, tensión infinita durante un período de tiempo: poción roja, y diferentes medallas que nos otorgan puntos.
Pese a la simplicidad del modo, es de agradecer la variedad que otorga al desarrollo del juego, y pese a que algunos combates sean algo complicadillos, por la poca energía que recuperarémos, sin duda será un aliciente más del título, en el aspecto innovador, ya que no se había incluido en ningún juego de lucha 2D, sería algo así como el Tekken Force o el Devil Within de los últimos Tekken, variedad, aunque no se convierta en parte imprescindible del juego.
Robo Ky Factory II nos permite comprar diversos golpes para diferentes versiones de este nuevo personaje, pudiendo personalizar parámetros como la velocidad, salto, ataque, defensa, velocidad de carga, fuerza, peso, poder de movimientos en el aire, espíritu, que disminuye la cantidad de daño que recibimos.
Podremos equipar diferentes juegos de movimientos, con ciertas restricciones, como no poder incluir movimientos con el mismo número preasignado. También se nos permitirá incluir fintas para movimientos (False Roman Cancels), renombrar al personaje, editar el color del mismo, e incluso enfrentar nuestra versión de Robo Ky II a la de otros personajes, con sus respectivas Memory Card.
Otro modo de juego nos permite personalizar la paleta de colores de los personajes, algo que Capcom ha incluido en varios de sus versus. De esta forma podremos modificar a nuestro gusto la apariencia de personajes como A.B.A., Robo Ky, Anji Mito, Baiken, Axl Low, Bridget, Chipp Zanuff, Dizzy, Eddie, Faust, I-No, Jam Kuradoberi, Johnny, Ky Kiske, May, Potemkin, Millia Rage, Slayer, Zappa, Testament, Venom o Sol Badguy.
