El sistema de juego de Mario Smash Football es bien simple, en ataque A servirá para pasar, B para tirar, R para correr, L para modificar tiros o pases, convirtiéndolos en pases altos o vaselinas, Y nos permitirá acceder a diversos regates y X al uso de objetos.
El sistema de tiros del juego nos permite realizar diversas acciones espectaculares. Si mantenemos el botón de disparo un rato, veremos como aparece un medidor de potencia en forma de arco, con dos puntos de control a ambos extremos, si conseguimos detener la barra móvil justo en cada uno de los dos marcadores, nuestro jugador realizará un tiro prácticamente imparable, salvo en contadísimas ocasiones. Estos tiros serán coto exclusivo de los capitanes de los equipos, los jugadores estrella : Mario, Daisy, Donkey Kong, Luigi, Pesadilla Robótica, Peach, Wario, Waluigi y Yoshi, que diferirán en su forma de llevar al equipo. Si conseguimos marcar de esta forma con uno de estos supertrallazos, el marcador aumentará con dos goles. El equipo Max, formado por diversos Pesadilla Robótica, contará con la particularidad de que todos los jugadores son idénticos, y pueden realizar supertrallazos.
Este tipo de lanzamientos da paso, si es realizado con éxito, a una espectacular secuencia CG realizada con el motor del juego, donde nuestro personaje con pose desafiante, realiza un tiro en medio de un enorme juego de luces y explosiones, desde el golpe tipo Kárate Kid de Waluigi, el puñetazo de Donkey Kong, la explosión de amor de Peach. En los niveles más bajos de dificultad, podremos realizar estos remates casi con total impunidad, pero no os llevéis a engaños, en cuanto subamos un nivel la dificultad, o juguemos contra un humano, será complicadísimo tener tiempo para completar toda la secuencia, ya que una carga o entrada cortará la jugada. Además el jugador rival puede modificar nuestro medidor, para dificultad aún más la consecución de este remate cuasidefinitivo, empleando el stick C. Según vayamos completando ciertos requisitos en el juego, podremos activar unas opciones que modifican el desarrollo de los partidos, entre ellas, hacer que estos supertrallazos sean imparables.
En caso de fallar el supertrallazo, el portero se quedará atontado, con estrellitas, por lo que habrá que intentar aprovechar el rebote con un segundo tiro que podría ser definitivo.
Por lo tanto, los objetos cobran especial protagonismo a la hora de brindarnos el tiempo necesario a la hora de realizar esta maniobra, y es que pese a la sencillez inicial del juego, no está totalmente desprovisto de cierto grado de estrategia o habilidad requerida para triunfar en el mismo, algo que los más hábiles pueden llegar a dominar de tal forma que pueda resultar un punto ligeramente negativo.
Además del supertrallazo, habrá otros tiros especiales que aumentan la probabilidad de marcar un tanto. Tendremos los tiros tras un pase de gol, identificados por una estela verde en el pase, que nos deja en una opción inmejorable para marcar, por lo que deberemos estar al tanto de cómo distribuir la pelota y asistir a un compañero mejor situado. También tendremos tiros con el balón muerto, o en tierra de nadie, al primer toque, tras un pase, bien por abajo o por alto, donde podremos ver voleas imposibles, chilenas, goles con efecto. Si cargamos el tiro, sin llegar a que aparezca la barra de supertrallazo, aumentaremos la potencia del tiro, y su efecto, con cierto grado de eficacia en los niveles más bajos, se tornará en prácticamente inútil según vayamos aumentando la dificultad. Podremos engañar al rival, haciendo una finta de tiro, al apretar el botón B y cargar, y sin soltarlo hacer un pase, si conseguimos que además sea pase de gol, tendremos medio gol en la bandeja.