Rogue Trooper funciona como un clásico juego de tiros en tercera persona. Nos movemos con el stick izquierdo y apuntamos con el derecho, siendo este apuntado ligeramente facilitado por Gunnar- nuestro amigo instalado en el rifle de asalto, con un nombre muy a juego- que se encarga de señalar a los enemigos y redirigir ligeramente el objetivo para que aumenten nuestras posibilidades de acertar, pero sin hacerlo demasiado fácil. Por lo demás, podemos saltar de lado para esquivar balas, pegarnos a superficies para cubrirnos y caminar sigilosamente para atacar a enemigos por la espalda. Lo cierto es que aunque existen posibilidades de jugar el juego en modo silencioso, el apartado de sigilo del juego no ha sido suficientemente pulido, haciendo el atacar a los enemigos por la espalda una tarea casi imposible, pues parecen todos dotados de super-vista-a-distancia y oído más fino que el de Mozart. Lo cierto es que el color azul tampoco es el más adecuado para camuflarse.

A través de nuestra aventura se van añadiendo al inventario más objetos que podemos utilizar. De esta manera, el juego tiene un abanico considerablemente amplio de posibilidades estratégicas, aunque la más efectiva suela ser abrirse camino a escopetazos por los niveles, tirando alguna granada de vez en cuando para darle más salero al desarrollo. Sin embargo, para aquellos que quieran explotar las posibilidades que ofrece el juego, puede usarse el rifle de asalto como arma centinela o colocar un señuelo holográfico para distraer a los enemigos y engañar a los francotiradores. También se suman al rifle de asalto y la pistola diversas armas, como la escopeta, el mortero, el francotirador, la pistola de rayos, el lanzacohetes contra vehículos y diversos tipos de granadas...en conjunto puede decirse que Rogue Trooper es mucho mejor juego de acción frenética que de sigilo.

Sin embargo, este sistema no está exento de defectos. A pesar de que se puede variar de estrategia, la escopeta es el modo más sencillo de abrirse paso a través de unos niveles generalmente lineales en exceso, cuya estructura sólo se rompe por niveles en que nos encargamos de llevar la artillería pesada de algún vehículo. La dificultad tampoco es demasiado elevada, posiblemente a causa de la curiosa forma de conseguir objetos que tenemos: para lograr actualizaciones o fabricar nuevos objetos (municiones, botiquines y granadas) disponemos de una serie de puntos. Estos puntos se consiguen cuando se revisa el cuerpo de un enemigo, y dada la enorme cantidad de puntos que ofrece cada enemigo abatido, y la cantidad de enemigos que hay, nunca nos van a faltar municiones o botiquines para curarnos, lo que hace que - salvo si nos encontramos en un combate muy frenético- sea casi imposible morir en combate.

El juego cuenta además con un modo multijugador. A pesar de que ahora mismo es difícil encontrar adversarios humanos online, se agradece que los mapas multijugador puedan ser jugados contra bots con uno o dos jugadores, haciendo así misiones donde es necesaria la colaboración. Aunque no es un añadido excepcionalmente grande y hay pocos mapas, ayuda a extender la vida del juego, y puede resultar muy divertido jugarlo con un amigo.