Sonic the Hedgehog 3

La tercera parte de las aventuras del erizo retoman la acción justo donde la había dejado la segunda, con el Death Egg cayendo del espacio, pero ante la sorpresa de todos, cae en Angel Island, una isla flotante de Mobius. Robotnik no se lo piensa dos veces y engaña a un indígena, Knuckles the Echidna para que le ayude a derrotar a Sonic; así, cuando el erizo y Tails llegan a bordo de la avioneta Tornado, el equidna se hace con las esmeraldas y se dedica a entorpecer los pasos de ambos héroes durante toda la aventura.
La tercera secuela de la saga no recibió tantos elogios como las anteriores, pero el juego que nos ocupa mostró diversas novedades la mar de interesantes: Tails por fin podía volar cuando lo controlábamos, se incluyeron distintos tipos de escudos, Sonic consiguió un doble salto, las fases especiales pasaron a ser un mundo esférico tridimensional, las fases, divididas en dos actos, tenían un artefacto como jefe final del primero y a Robotnik como jefe del segundo, las travetas de Knuckles en medio de la partida...
El problema de este juego es que era corto, tenía la mitad de fases que la entrega anterior y encima un final muy precipitado, con una explosión del Death Egg justo al elevarse que enviaba a Sonic a la otra punta de la isla y expulsaba a Tails de ella, mientras que dejaba a Robotnik el campo libre en el Sky Sanctuary. Este final dejó claro que se trataba de la primera mitad de un juego más largo, cosa que no gustó ni a crítica ni a jugadores, ya que se preguntaron el por qué no se había hecho directamente el juego completo.

Sonic & Knuckles

Pocos meses después de la salida de Sonic 3 hacía la aparición de la segunda parte de las aventuras del erizo en Angel Island. Tras la explosión del final del anterior juego, Tails cae de la isla, Sonic sale rebotado a Mushroom Hill donde Knuckles le espera para seguir poniéndole trabas y Robotnik recibe la lotería, el Death Egg se estrella en el Sky Sanctuary, el lugar sagrado que es el origen de las Esmeraldas y que está sobre el Hidden Palace, lugar que oculta la Esmeralda Maestra. Con las apariciones de Eggrobo y Robosonic el científico tiene tiempo de robar esta poderosa joya, que solo podemos recuperar si Sonic (o Knuckles, que debuta como personaje controlable) consigue las siete esmeraldas y se enfrenta e él en una fase oculta. El cartucho tenía una ranura superior en la que insertar los demás juegos de la saga, consiguiendo muchos extras, ya que los tres juegos anteriores ofrecen nuevas aventuras.

Sonic 3 & Knuckles

Ensamblando Sonic & Knuckles a Sonic 3, ambos juegos se fusionan en uno solo, pudiendo jugar con los tres personajes (el erizo, el zorro y el equidna) las fases de ambos juegos seguidas y enlazando ambas historias. Este ensamblaje ofrece, entre otras cosas, la posibilidad de convertir a los héroes en su versión "hyper", ya que se juntan catorce Esmeraldas del Caos (siete de cada juego), una versión más poderosa que la súper.

Knuckles in Sonic 2

Ensamblando Sonic & Knucles a Sonic 2, Knuckles se convierte en personaje controlable y podemos jugar a ese título con el equidna y sus habilidades.

Blue Sphere

Ensamblando Sonic & Knuckles a Sonic 1 lo único que podemos obtener es la entrada a la Blue Sphere, un mundo con más de un millón de fases especiales del mismo tipo que Sonic 3 al meter un código. Si no hay más es porque el color de Knuckles no es compatible con la paleta del primer Sonic.