Aunque el modo historia es el modo principal, existen varios modos de juego más, añadiendo incluso modos multijugador, cubriendo así una de las carencias de la primera entrega. En el modo Recuerdos es a donde van a parar todos los minijuegos completados en el modo principal, para ser rejugados cuando se quiera, aunque con cambios. En esta ocasión sólo disponemos de una vida y de diez niveles de dificultar por completar para cada prueba. En el modo Ataque tendremos algunas de las pruebas superadas en el modo historia y alguna más de propina para completarlas en el menor tiempo posible. El juego registra los tres mejores tiempos conseguidos en cada minijuego.
El modo Locura, aunque no es un modo de juego propiamente dicho, sirve para cambiar el aspecto de la chica protagonista. Consiguiendo puntos en el modo historia y completando pruebas en los modos Recuerdos y Ataque, se desbloquearán nuevos trajes para la chica, que incluyen distintos peinados y calzado que se pueden combinar a nuestro gusto. Pero además, existe la interesante opción de crear nuestros propios diseños, partiendo desde uun bikini o desde un vestido en blanco. Con la pantalla táctil podremos dibujar una textura para aplicar a la indumentaria de la chica o para intercambiar con otras Nintendo DS por conexión inalámbrica.
Para el multijugador, The Rub Rabbits ofrece todo tipo de posibilidades, como juego multicartucho, con un único cartucho, e incluso con una única consola. El multijugador con un único cartucho permite jugar hasta cuatro jugadores en distintos minijuegos del modo historia, aunque no todos están disponibles según el número de personas que vayan a jugar.
Para jugar con una única consola, hay dos modos de juego, llamados Hullabaloo y Hacer Bebés. El primero de ellos es bastante extraño, pero muy efectivo cuando hay muchos amigos con quien jugar, pues el número de jugadores es ilimitado. Básicamente es como un paso de testigo, en el que los jugadores se deben ir pasando la consola hasta que se rompa la cadena. Para ello, el primer jugador tiene que mantener pulsado el botón que el juego diga, y sin soltarlo, debe pasar la consola a un amigo, quien deberá pulsar otro botón antes de que el primer jugador suelte el suyo. Y así sucesivamente, hasta que alguien se equivoque haciendo el intercambio, ya sea pulsando un botón que no es, o soltando antes de tiempo.
El modo "hacer bebés" no es como estáis pensando, aunque el resultado final de esta prueba será un bebé. Es un juego para dos jugadores en la misma consola, especialmente pensado para parejas. Cada jugador debe sujetar la consola por un lado e introducir una serie de datos que el juego irá pidiendo, como día y mes de nacimiento, edad o grupo sanguíneo, antes de pasar a la prueba en sí. El juego consiste en cortar una tarta de bodas entre los dos novios que sujetan la misma espada, por lo que ya imagináis de que va esto. Los dos jugadores deberán sincronizar sus movimientos para conseguir el corte más limpio posible, y al terminar, saldrá un bebé al cual podemos bautizar.
El juego multitarjeta se activa automáticamente cuando detecta otra Nintendo DS dentro de su radio de alcance que esté utilizando otra copia de The Rub Rabbits y que tenga un bebé creado, siendo muy similar al modo ladrido de
Nintendogs. El resultado de esta conexión es la posibilidad de intercambios diseños propios creados para el vestuario de la chica, y dejar que los bebés jueguen juntos. No es que sea una posibilidad muy fructífera, pero al menos queda como una opción bastante curiosa que, suponemos, tendrá mayor aceptación en Japón que por nuestras tierras.
