Tras una incipiente cantidad de rumores acerca de la plataforma de destino de Ninja Gaiden 2, la secuela del exitoso título de acción de Xbox, el equipo de programación de Tecmo, liderado por Tomonobu Itagaki, confirmó en septiembre de 2006, durante la celebración del Tokio Game Show, que PlayStation 3 iba a recibir una versión ampliada de la entrega original de Xbox, que añadiría aún más contenidos a la expansión: Ninja Gaiden Black.
De esta forma, los clásicos cambios de plataforma de un equipo de programación apasionado con la tecnología punta, no afectarían tan de lleno a los usuarios de Xbox 360, con los que el equipo de desarrollo parecía más comprometidos, al lanzar Dead or Alive 4, y continuar la exitosa serie de lucha que había brindado a los usuarios de la primera consola de Microsoft, dos títulos excepcionales de lucha tradicional: Dead or Alive 3 y Dead or Alive: Ultimate, así como el mencionado Ninja Gaiden y su expansión Black, o el peculiar Dead or Alive: Xtreme Volleyball. De momento Team Ninja no dejaba tirados a los usuarios de Microsoft, lanzando secuela alguna de las series que ya parecían instaladas en las plataformas de la compañía de Redmond, y los usuarios de PlayStation 3 se iban a tener que contentar con una reedición de un juego de anterior generación.
Los contenidos mostrados de Ninja Gaiden Sigma durante la celebración del Tokio Game Show no eran todo lo espectaculares que debieran, pese a los nuevos escenarios/niveles, la adición de personajes controlables, y la lógica mejoría gráfica, mostrando todas las secuencias de la historia en tiempo real. El equipo de programación de Tecmo, acostumbrado a exprimir gráficamente todos los sistemas sobre los que programa, como demostró con Dead or Alive para Model 2, Dead or Alive 2 para Naomi, o el mencionado Ninja Gaiden de Xbox, no había dispuesto de suficiente tiempo para aprovechar las peculiaridades de Cell, y el juego no ofrecía el salto técnico respecto a los productos de Xbox 360, que debieran justificar la tan cacareada potencia de la consola de Sony.
Más allá de estos detalles, el equipo de desarrollo confirmaba a Rachel como personaje jugable, con su propio punto de vista de la historia; así como nuevos movimientos, como disponer de dos espadas a un tiempo, y armas para Hayabusa. Se confirmaba también que el acabado del producto era de un 25%, y que de momento no se disponía de fecha prevista de lanzamiento.
Justo tras la celebración del Tokio Game Show, Andy Szymanski, uno de los componentes del Team Ninja, comentaba que Ninja Gaiden Sigma no iba a expandir la historia de Ninja Gaiden Black, si no que se nos mostrarían ciertos acontecimientos que transcurrieron a la vez que otros que afectaban a Ryu Hayabusa, y que nos mantuvieron "ocupados" durante el desarrollo del Ninja Gaiden original. Así podríamos conocer más en profundidad ciertos detalles del imperio Vigoriano.
Szymanski confirmaba que además de nuevos jefes en la historia principal, como el que se mostró en el tráiler de tres minutos del TGS, y que ya aparecía dentro del modo misión de Ninja Gaiden Black, podríamos ver nuevas incorporaciones, tanto a la nómina de jefes, como de enemigos de a pie. La adición de las dos katanas simultáneas, modificaba la estrategia para los combates, y además se estaba poniendo especial interés en centrarse en la mejora de las armas arrojadizas, como los shuriken, y el arco. De esta forma, se aumentaría su efectividad, y podríamos cambiar más fácilmente en función de nuestras preferencias entre una estrategia centrada en el combate cuerpo a cuerpo, o empleando armas a distancia.
Dentro de los apartados técnicos menos obvios a primera vista, los programadores se estaban centrando en mejorar las animaciones, haciéndolas más rápidas y fluidas, además de retocar intensivamente el comportamiento de la CPU en las luchas. PlayStation 3 es una consola que permite avanzar a pasos agigantados en términos de IA, mucho más compleja que la que podríamos obtener en Xbox, y los desarrolladores estaban poniendo toda la carne en el asador para que los combates de Ninja Gaiden Sigma se vieran beneficiados de ello.
Uno de los aspectos más polémicos de la franquicia, los niveles de dificultad altísimos, que hacían que muchos usuarios tuvieran que desistir pese al atractivo de las diferentes versiones de Xbox, va a ser revisado, pero no temáis, no se va a reducir el nivel de dificultad de todo el producto, si no adaptarse mediante diferentes niveles a todos los públicos, desde novatos, hasta los hardcore gamers más apasionados, y es que el Team Ninja no se caracteriza por defraudar a los jugadores más avezados. Los desarrolladores tienen muy claro que uno de los puntos fuertes de la serie es su nivel de desafío, y la satisfacción que obtenemos al derrotar a un jefe particularmente complicado, y se está teniendo en cuenta este aspecto, aunque ponderado por el posible bloqueo de ciertos usuarios en algunos puntos del juego.
