El título comenzará con nuestra elección de sexo para el ranger novato que encarnaremos. Esta elección determinará si nuestro Pokémon inicial, el único que nos acompańará de forma constante a lo largo del título, es un Minum, si elegimos a un personaje varón, o un Plusle, para una fémina. Hemos comentado que nuestro Pokémon inicial será el único que nos acompańe a lo largo de todo el título, ya que el resto que vayamos capturando, tendremos un límite inicial de cuatro, que irá aumentando conforme avancemos por las misiones, hasta llegar a siete, se marcharán tras usarlos en un puzzle ambiental, o agotarse el tiempo de uso en las batallas con el Capture Styler.
Como ranger novato de la tierra de Fiore, seguiremos las órdenes de Hayate, el líder de los Ranger en la Ciudad Anillo, visitando más adelante Fall City, Summerland, Wint Town, ciudades donde existen centros Ranger, que dependen a su vez del Profesor Shinbara, el inventor del Capture Styler. A lo largo de las misiones del título, iremos avanzando en el sencillo y accesorio argumento del juego, de hecho, en la versión japonesa del título que hemos probado, hemos conseguido avanzar y completar más de la mitad del juego sin enterarnos de su historia, prueba de su importancia totalmente secundaria, ya que además las misiones serán bastante lineales, sencillas y estarán explicadas mediante secuencias de diálogo bastante gráficas. De todos modos, y antes de que lleguen las ediciones occidentales del juego, debemos deciros que nuestro objetivo será luchar contra el Team GoGo y desbaratar sus planes, a la vez que vamos escalando en el escalafón Ranger, lo que nos permite aumentar nuestros parámetros de vida y energía especial del Styler, el número de Pokémon que podemos almacenar a un tiempo, los tipos de asistencia que nos otorgarán, etc.
El Team GoGo está liderado por Ragou, un antiguo colega de Shinbara, quien, envidioso de su fama, roba un nuevo dispositivo llamado Super Styler, y captura a los Pokémon legendarios: Entei, Raikou y Suicune, así que nuestra tarea final será liberarlos. Nos encontraremos desde bien pronto con administradores rivales, quienes nos atacarán con sus Pokémon. Entrando en una clásica secuencias de captura, deberemos utilizar el Capture Styler para atraparlos, momento en el que saldrán corriendo. Una vez que desbaratemos los planes del Team GoGo, a través de diez misiones de dificultad y longitud creciente, veremos como tratan de hacerse con Kyogre, Groudon y Rayquaza, lo que dará acceso tras los títulos de crédito a nuevas misiones extra.
A diferencia de los títulos de Pokémon de Game Freak, en este juego no deberemos subir de nivel a nuestros Pokémon, ni asignarles objetos, ni hacerles aprender habilidades. Existirán diferentes Pokémon, 210, que deberemos avistar, rellenando el equivalente a la Pokédex, lo que nos otorgará un emblema especial.
Pasemos a explicar la tarea de captura de Pokémon, que como el resto de controles del juego, se realizará a través del stylus y la pantalla táctil. Nuestro Capture Styler dispondrá de una barra de vida, que disminuirá cada vez que uno de nuestros trazos sea golpeado o golpee a un ataque del Pokémon que queramos atrapar. Además, debajo de la barra de vida, que encontraremos en la parte superior izquierda, veremos una barra de menor tamańo que nos permite realizar los ataques especiales con los Pokémon en pleno combate a modo de asistencia. De esta forma, al realizar círculos concéntricos cercanos al Pokémon que queramos capturar, iremos disminuyendo sus puntos de vida hasta llegar a cero, momento en el cual, si seguimos dibujando a su alrededor, uniendo el punto de inicio con el extremo del dibujo, iremos acumulando puntos extras de experiencia, hasta que toquemos al Pokémon, y caiga en nuestras redes.
Esta tarea no será tan sencilla como aparenta, ya que conforme vayamos avanzando, nos iremos encontrando con Pokémon más resistentes, con más "puntos de vida", con mayor actividad en forma de movimientos que cancelen nuestras secuencias de presa, e incluso ataques que romperán nuestro círculo, haciendo que debamos reiniciar la tarea, perdiendo puntos de vida del Capture Styler. Además, aparecerán varios Pokémon en Pantalla, dificultando la tarea, y haciendo que debamos acometer su captura por separado, esperando a que vayan a zonas distintas de la pantalla, o demostremos nuestra maestría y velocidad con el stylus para hacernos con todos de un plumazo.
Estos sencillos combates tienen cierto grado de estrategia, al dibujar círculos más amplios que aunque no reduzcan la energía del rival, eviten sus ataques, en caso de que no tengan demasiado rango, aunque especialmente estarán determinados por los apoyos de los Pokémon que se encuentren en nuestro equipo en ese momento. Pasemos a describir este aspecto.
