En StarCraft: Ghost veremos el escenario desde la perspectiva de un soldado, pues adoptaremos el papel de Nova, un letal Ghost entrenado eficientemente en el arte del espionaje y el combate táctico. Tras 20 años de duro entrenamiento físico e instrucción tecno-psicológica han hecho de Nova un ser de un increíble potencial. Con la ayuda de nuestro aliados deberemos completar una serie de misiones a través de las cuales se desarrolla el argumento, envueltos en dramáticos combates planetarios a vida o muerte y misiones en solitario donde demostrar nuestra verdadera valía. Para completar las misiones deberemos tomar decisiones inteligentes y hacer uso de un sofisticado armamento.