La trama de Crisis Zone se desarrolla en un complejo recientemente inaugurado, Garland Square, situado en la periferia de Londres. Un grupo terrorista fuertemente armado denominado U.R.D.A., se ha apoderado de él tras un ataque y ha tomado la zona. Aún se desconocen sus motivos, pero la misión del jugador, tomando el papel de Claude McGarren, un oficial de las fuerzas antiterroristas de elite S.T.F (Fuerzas Tácticas Especiales), será proteger Garland Square y eliminar a los terroristas de U.R.D.A, con los medios que crea necesarios.