Situado en la antigua tierra mitológica de Persia, el Príncipe se encuentra entre una batalla épica entre las fuerzas de la luz y de la oscuridad: el Dios de la Luz, Ormazd, contra su hermano Ahriman, el destructivo Dios de la Oscuridad. El Príncipe llega justo en el momento de presenciar la destrucción del legendario Árbol de la Vida - un acto que amenaza con hundir al mundo en la oscuridad entera. Manifestado con la forma de la Corrupción, una sustancia oscura que contamina la tierra y el cielo, el Príncipe se tiene que asociar con Elika, una mortífera compañera, para salvar el mundo de la Corrupción diabólica.