El equipo desarrollador de Symphony of the Night y de Harmony of Dissonance, vuelve a un sistema de armas, sub-armas y hechizos clásico en la saga. El control utilizado emplea un botón para el salto, otro para el látigo, y los botones L y R, que nos servirán para acercarnos ó evitar al rival, bastante útiles también para desplazarse a toda velocidad por el escenario. Con arriba + B, usaremos el arma secundaria, que al igual que en las demás entregas de la saga, emplea energía de la barra de Maná. Dentro de estas sub-armas veremos las clásicas en la saga : Cruz, Hacha, Cuchillo, Agua Bendita, Libro Sagrado y Puño Sagrado, cada una de ellas útil para ciertos enemigos en función de las debilidades de los mismos.
Como novedad en la saga, y a diferencia de lo ocurrido en Symphony of the Night, donde nuestro protagonista debido a su ascendencia vampírica tenía mayor facilidad para realizar los hechizos, que podían emplearse en cualquier momento del juego a la manera de golpes de un juego de lucha, en Harmony of Dissonance, dependeremos de los libros de hechizos diseminados por el escenario. Encontraremos un libro de fuego, otro de hielo, relámpago, viento y por último el libro de invocación que te permitirá llamar a diversas apariciones procedentes del infierno, cada una correspondiente a un arma secundaria.
Estos libros junto con diferentes piedras, añadirán a tu arma principal, el latigo, una serie de efectos, así como cambiarán el efecto de las sub-armas. Existen ciertas combinaciones que deberás descubrir experimentando por ti mismo, de libros de hechizos y sub-armas, que generan unos ataques de un poder bastante mayor al normal, como por ejemplo el Alma de Hidra que invoca a dos dragones que lanzan fuego por la boca, y que se realizará con el Libro de Fuego más el sub-arma del hacha.
Por el extensísimo mapa del juego deberemos buscar a Lydie, mientras vamos derrotando a los jefes de cada zona, y ganando las habilidades que nos permitirán acceder a nuevas localizaciones hasta el momento inaccesibles. Brazaletes, tres clases de llaves, que utilizadas en lugares muy específicos harán que ciertas zonas cambien de apariencia, así como otros puzzles que deberemos resolver nos harán recorrer el castillo a fondo muchas veces para conseguir encontrar los objetos necesarios para aumentar nuestras capacidades.
El menú de juego, al que accedemos con el botón Start, nos mostrará la pantalla de estado, en la que veremos los puntos de vida y magia de nuestro personaje, así como el número de corazones máximo del que disponemos, parámetros como la fuerza, defensa, inteligencia, status, y el estado del personaje, que podrá ser alterado si nos envenenan, nos convierten en piedra, o nos echan una maldición, todos ellos podrán ser contrarrestados con el correspondiente ítem, y además más adelante en el juego podrán ser evitados con ciertos objetos.
Iremos ganando puntos de vida y corazones, encontrando las diferentes urnas de vida y corazones grandes diseminados por el mapa, además de subiendo de nivel al alcanzar los puntos de experiencia requeridos, o tras matar a un jefe. Para sobrevivir a la aventura iremos encontrando una serie de objetos como pociones de vida, de maná, para recuperar la barra de magia, alimentos que recuperarán en menor medida nuestra vida, y toda clase de objetos que podremos equiparnos para modificar los parámetros de nuestro personaje, desde armas, a armaduras, anillos, botas que nos permitirán romper los techos débiles, piedras que posibilitarán romper muros que encuentren debilitados, así como joyas y monedas de oro que podremos emplear para comprar al mercader diferentes objetos.
