Como sucesor de Pokémon Stadium, este juego nos trae nuevos y desafiantes combates entre Pokémon basados en las novedades jugables de Zafiro y Rubí para GBA. Podrás disputar combates dobles o individuales, contra jugadores humanos o contra la CPU. Podrás usar tus propios pokémon conectando la GBA con la GCN y utilizar en combate pokémon que no aparecen en Zafiro y Rubí, como Feraligatr, Meganium o Typhlosion. Incluye también un novedoso modo de juego en el que atrapar pokémon que no aparecen en rubí y zafiro para después quedártelos en tu juego de GBA.